Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms