Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28419-201ENSMUST00000189108 475 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm4208-201ENSMUST00000189802 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 4933438B17Rik-201ENSMUST00000196336 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm45827-201ENSMUST00000211955 311 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Pfdn5-202ENSMUST00000062492 464 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Nol11-202ENSMUST00000106757 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ccdc162-211ENSMUST00000190522 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Slc17a1-202ENSMUST00000110413 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 1700112J16Rik-201ENSMUST00000181631 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Slco2b1-201ENSMUST00000032985 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Atp7b-202ENSMUST00000110738 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44037-201ENSMUST00000204816 1891 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sprr2a2-201ENSMUST00000071805 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cep112-206ENSMUST00000130515 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Bank1-203ENSMUST00000196159 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ctrcos-201ENSMUST00000128368 322 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm11314-201ENSMUST00000148492 541 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ube2i-212ENSMUST00000174001 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC123692.2-201ENSMUST00000226272 342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfm5-201ENSMUST00000051137 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr954-202ENSMUST00000214818 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gatb-204ENSMUST00000127348 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37315-201ENSMUST00000194347 3479 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Asic2-202ENSMUST00000066197 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Itm2a-201ENSMUST00000033591 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28187-201ENSMUST00000186885 2134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms