Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms