Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr6-202ENSMUST00000213552 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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