Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
RxraP28700 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
RxraP28700 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RxraP28700 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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