Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm44987-201ENSMUST00000206578 750 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr1090-203ENSMUST00000217043 2054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Zbtb44-206ENSMUST00000217092 2472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm37539-201ENSMUST00000192644 235 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sptan1P16546 Grip1-207ENSMUST00000130387 2780 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms