Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nbdy-206ENSMUST00000208373 1061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gimd1-204ENSMUST00000212804 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms