Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf39A2RT81 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms