Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr1320-201ENSMUST00000096449 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr1418-201ENSMUST00000079875 1072 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms