Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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