Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms