Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mtfr1-203ENSMUST00000119865 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm37168-201ENSMUST00000192965 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14336-201ENSMUST00000117491 475 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6136-201ENSMUST00000120149 891 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7027-201ENSMUST00000086958 862 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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