Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 9330121K16Rik-201ENSMUST00000211464 3886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Trim39-201ENSMUST00000042717 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm20507-201ENSMUST00000163245 2860 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Casp8-203ENSMUST00000190213 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Palmd-201ENSMUST00000040097 2433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Rpl36-ps1-201ENSMUST00000119508 303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm5313-201ENSMUST00000182893 987 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Prr7Q3V0I2 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm39164-202ENSMUST00000211519 236 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Abcb1b-201ENSMUST00000009058 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 St3gal6-201ENSMUST00000114357 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Prr7Q3V0I2 Aldh18a1-201ENSMUST00000025979 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm26633-201ENSMUST00000180546 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Ptafr-201ENSMUST00000070690 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prr7Q3V0I2 Gm3839-201ENSMUST00000181173 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Prr7Q3V0I2 L3mbtl3-202ENSMUST00000105519 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 BC039771-202ENSMUST00000144661 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm12841-201ENSMUST00000128263 338 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prr7Q3V0I2 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms