Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gngt2-206ENSMUST00000107712 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm14044-201ENSMUST00000117531 447 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12364-201ENSMUST00000144419 547 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 B020031M17Rik-202ENSMUST00000180768 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Slc35a4-205ENSMUST00000185899 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Zg16-201ENSMUST00000051122 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Zmym6-202ENSMUST00000094713 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Atp5g1-204ENSMUST00000178611 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Htr1d-202ENSMUST00000117699 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Tc2n-204ENSMUST00000162735 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Trim43b-201ENSMUST00000167113 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Igkv4-86-201ENSMUST00000103337 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ighv1-7-201ENSMUST00000103496 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm24432-201ENSMUST00000104075 126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pla2g2d-202ENSMUST00000105806 1206 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12353-201ENSMUST00000108250 554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm13784-201ENSMUST00000119639 519 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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