Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 CT572998.1-201ENSMUST00000219636 1557 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtpbp6Q3U6U5 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gtpbp6Q3U6U5 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24432-201ENSMUST00000104075 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms