Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Numb-204ENSMUST00000117217 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nedd1P33215 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms