Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 D330037F02Rik-202ENSMUST00000217400 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Anapc15-205ENSMUST00000106978 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12312-201ENSMUST00000120351 644 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm13673-201ENSMUST00000122056 531 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 E330017L17Rik-204ENSMUST00000145196 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms