Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms