Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp54Q8BL06 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms