Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13049-201ENSMUST00000133196 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Uba52-206ENSMUST00000135446 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm6851-201ENSMUST00000154478 395 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13997-201ENSMUST00000155641 336 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm45866-201ENSMUST00000212425 326 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 4933404K13Rik-203ENSMUST00000217125 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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