Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm13645-201ENSMUST00000145163 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm20936-201ENSMUST00000191049 658 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Pafah1b2-203ENSMUST00000214179 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1184-201ENSMUST00000050038 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm25704-201ENSMUST00000083116 168 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Synj2-205ENSMUST00000115786 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm38024-201ENSMUST00000192338 2532 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mboat2-202ENSMUST00000110942 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ednrb-202ENSMUST00000172237 3989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gpr83-202ENSMUST00000115624 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mrpl11-201ENSMUST00000025836 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ctse-202ENSMUST00000112411 1837 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Zwint-201ENSMUST00000020081 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Lrrc23-201ENSMUST00000032218 1470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Txnrd1-205ENSMUST00000219368 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm6524-201ENSMUST00000209673 1443 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Crbn-201ENSMUST00000013882 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 C330002G04Rik-201ENSMUST00000181623 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tmx2-201ENSMUST00000053664 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ncaph2-202ENSMUST00000074552 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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LtbrP50284 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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LtbrP50284 Gm37942-201ENSMUST00000191875 628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm5979-201ENSMUST00000193850 571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC123944.1-201ENSMUST00000213414 160 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm36208-201ENSMUST00000220013 429 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC133087.1-201ENSMUST00000221837 148 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44541-201ENSMUST00000207837 2907 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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