Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm26992S4R1A3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms