Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms