Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PoleQ9WVF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PoleQ9WVF7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms