Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms