Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hacd1Q9QY80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hacd1Q9QY80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms