Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Apbb1Q9QXJ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms