Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clca3a1Q9QX15 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clca3a1Q9QX15 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3a1Q9QX15 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3a1Q9QX15 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3a1Q9QX15 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clca3a1Q9QX15 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms