Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LitafQ9JLJ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms