Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms