Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms