Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ybx3Q9JKB3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms