Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms