Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx20Q9JJY4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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