Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccl28Q9JIL2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccl28Q9JIL2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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