Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtaQ9JHK4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms