Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Cxcl11Q9JHH5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Cxcl11Q9JHH5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Cxcl11Q9JHH5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Cxcl11Q9JHH5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Cxcl11Q9JHH5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxcl11Q9JHH5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Cxcl11Q9JHH5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Cxcl11Q9JHH5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Cxcl11Q9JHH5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Cxcl11Q9JHH5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Cxcl11Q9JHH5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl11Q9JHH5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms