Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chst1Q9EQC0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms