Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms