Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms