Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e2Q9D902 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms