Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms