Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl4Q9D8E6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms