Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X3

Dusp3, Dual specificity protein phosphatase 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp3Q9D7X3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp3Q9D7X3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp3Q9D7X3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms