Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd2Q9D7V2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms