Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShpkQ9D5J6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms