Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7Q9D541 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7Q9D541 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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