Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1dQ9D4V4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1dQ9D4V4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1dQ9D4V4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms