Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms