Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxxc1Q9CWW7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms